29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1940 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
651 aa  1300    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.44 
 
 
641 aa  355  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.01 
 
 
627 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.91 
 
 
489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 
476 aa  269  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 
627 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.82 
 
 
630 aa  136  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.63 
 
 
470 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.18 
 
 
173 aa  51.6  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  36 
 
 
619 aa  48.1  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1704  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.88 
 
 
159 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.25 
 
 
491 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  34.57 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.06 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  35.71 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2043  polysulfide reductase, subunit B, putative  40.35 
 
 
199 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.507681  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 
154 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2009  formate dehydrogenase, beta subunit  33.62 
 
 
290 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.340438  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
490 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24560  DMSO reductase, iron-sulfur subunit  44.68 
 
 
209 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  37.25 
 
 
110 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
634 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
491 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 
144 aa  43.9  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>