More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3536 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
841 aa  1708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  65.48 
 
 
841 aa  1159    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  67.14 
 
 
837 aa  1115    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  54.53 
 
 
838 aa  872    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.01 
 
 
695 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  45.64 
 
 
662 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.06 
 
 
857 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 
860 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  25.03 
 
 
785 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.76 
 
 
476 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.83 
 
 
462 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.49 
 
 
476 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  24.74 
 
 
918 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1282  putative GAF sensor protein  33.06 
 
 
509 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.76 
 
 
459 aa  108  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.05 
 
 
465 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3199  Fis family transcriptional regulator  31.18 
 
 
520 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 
516 aa  105  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3375  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.2 
 
 
461 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.98 
 
 
447 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1300  putative phytochrome sensor protein  29.18 
 
 
518 aa  104  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2923  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.45 
 
 
450 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.91 
 
 
458 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.44 
 
 
512 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.03 
 
 
457 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2522  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.47 
 
 
509 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0168  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 
459 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564625  normal  0.730975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.36 
 
 
457 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  30.08 
 
 
456 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  31.56 
 
 
671 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0197  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30.12 
 
 
1098 aa  101  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.793641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2742  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.4 
 
 
469 aa  101  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0962  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.1 
 
 
458 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2849  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.4 
 
 
469 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.1 
 
 
464 aa  100  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 
466 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.13 
 
 
466 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2674  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.74 
 
 
469 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.71 
 
 
449 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  30 
 
 
537 aa  99.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0747  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.74 
 
 
464 aa  98.6  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.38 
 
 
457 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3286  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.77 
 
 
458 aa  98.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  29.58 
 
 
459 aa  98.6  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0338  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.3 
 
 
552 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2617  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.64 
 
 
535 aa  98.2  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  27.78 
 
 
533 aa  98.2  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.39 
 
 
454 aa  98.2  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0582  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.85 
 
 
517 aa  98.2  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 
449 aa  97.8  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.17 
 
 
457 aa  97.8  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5446  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.34 
 
 
347 aa  97.8  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1966  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30 
 
 
526 aa  97.8  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6042  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.84 
 
 
344 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220218  normal  0.564573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  27.54 
 
 
512 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1379  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.23 
 
 
384 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.730232  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0020  sigma-54 dependent transcriptional regulator  27.94 
 
 
530 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6450  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.23 
 
 
384 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  29.92 
 
 
532 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3359  NifA subfamily transcriptional regulator  28.92 
 
 
674 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.68 
 
 
470 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.22 
 
 
521 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  28.49 
 
 
515 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0902  Fis family transcriptional regulator  26.88 
 
 
551 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0336784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.46 
 
 
481 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6394  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.09 
 
 
356 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  27.16 
 
 
512 aa  95.9  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  29.51 
 
 
472 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0548  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.96 
 
 
452 aa  95.9  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.902927  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2282  Fis family transcriptional regulator  31.38 
 
 
507 aa  95.9  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.51 
 
 
447 aa  95.5  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.47 
 
 
480 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 
698 aa  95.5  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.91 
 
 
482 aa  95.5  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1169  sigma-54 dependent response regulator  28.14 
 
 
460 aa  95.1  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247521  normal  0.480533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3367  response regulator receiver protein  32.64 
 
 
508 aa  95.1  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0023  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.12 
 
 
319 aa  95.1  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.94 
 
 
465 aa  95.1  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  30.68 
 
 
696 aa  95.1  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5646  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.09 
 
 
356 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0704244  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.22 
 
 
635 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  28.24 
 
 
474 aa  94.7  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.91 
 
 
459 aa  94.7  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1319  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.47 
 
 
457 aa  94.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4753  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.48 
 
 
557 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.050677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.85 
 
 
684 aa  94.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0103  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.42 
 
 
519 aa  94.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000150576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  29.54 
 
 
575 aa  94.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02780  vanadium nitrogenase sigma54-dependent transcriptional activator, VnfA  29.13 
 
 
522 aa  94.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0594  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  28.87 
 
 
529 aa  94  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00846378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1492  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.26 
 
 
569 aa  94  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  30.25 
 
 
511 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4257  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.95 
 
 
385 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1407  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.57 
 
 
456 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.14 
 
 
525 aa  94  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3906  transcriptional regulator, Fis family protein  28.88 
 
 
480 aa  94  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3823  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  29.3 
 
 
517 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.83 
 
 
468 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.36 
 
 
462 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3238  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.84 
 
 
662 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0144494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>