70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3606 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  100 
 
 		 461 aa  919    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  63.6 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  62.09 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  62.72 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  61.62 
 
 		 466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  61.37 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  61.37 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  61.37 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  61.67 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  62.58 
 
 		 466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  62.8 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  62.25 
 
 		 465 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  61.37 
 
 		 465 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  61.37 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  56.14 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  53.08 
 
 		 457 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  52.85 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  54.78 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  54.12 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  51.97 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  43.89 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  37.72 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  51.02 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  50.61 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.55 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 841 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 860 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.84 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  30.14 
 
 		 838 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  24.78 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 841 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 		 837 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  22.78 
 
 		 918 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.4 
 
 		 695 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.79 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  21.04 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  33.52 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  20.77 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 785 aa  60.1  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  28.06 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  26.55 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.6 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  27.22 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  26.6 
 
 		 715 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.39 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  25.81 
 
 		 715 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  25.25 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  23.04 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  23.77 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.14 
 
 		 357 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 273 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  25.77 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 357 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  21.39 
 
 		 300 aa  43.1  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>