79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0428 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  98.64 
 
 		 440 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  847    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  62.11 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  41.18 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  39.41 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  40.61 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  40.05 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  38.84 
 
 		 457 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  41.87 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  40.42 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  39.9 
 
 		 477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  39.81 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  41.39 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  41.63 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  41.63 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  41.63 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  41.63 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  41.15 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  39.81 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  40.94 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  39.57 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  39.34 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  39.11 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  39.11 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  38.88 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  41.65 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  40.18 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  39.62 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  39.81 
 
 		 461 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.72 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.45 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.51 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 841 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  24.62 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  22.41 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  27.14 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 		 841 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.21 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 837 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  24.14 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  32.59 
 
 		 838 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.49 
 
 		 695 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.09 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.09 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  23.2 
 
 		 480 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.09 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.23 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  28.22 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.09 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  29.19 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.57 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.88 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.57 
 
 		 356 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  27.81 
 
 		 463 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.87 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  29.5 
 
 		 662 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.81 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.03 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.54 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  22.28 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.9 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  26.97 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  28.28 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0304  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.06 
 
 		 954 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.24 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0304  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 954 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.9 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  25.97 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  22.66 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.7 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  27.39 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  22.27 
 
 		 857 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>