64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0384 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  99.12 
 
 		 457 aa  912    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  961    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  58.8 
 
 		 484 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  57.41 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  56.35 
 
 		 471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  53.86 
 
 		 469 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  54.22 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  56.97 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  54.07 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  54.08 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  53.59 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  54.37 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  54.17 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  53.86 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  53.86 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  53.63 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  53.64 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  53.64 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  54.37 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  52.85 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  46.79 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  41.14 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  43.98 
 
 		 440 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  50 
 
 		 440 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.36 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.34 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  23.71 
 
 		 918 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  29.41 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.7 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.23 
 
 		 841 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  26.35 
 
 		 837 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  27.4 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  23.58 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  20.55 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  31.79 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.21 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  22.54 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  31.65 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  24.53 
 
 		 292 aa  53.5  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  24.38 
 
 		 785 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  26.47 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.84 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  23.02 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.69 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  23.04 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  23.12 
 
 		 857 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.14 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  22.41 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.41 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  29.55 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.41 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 224 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.147143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.29 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>