More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02717 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02717  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  100 
 
 
561 aa  1114    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3031  putative sigma54 specific transcriptional regulator  67.42 
 
 
527 aa  648    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265414  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3276  proprionate catabolism activator, Fis family  47.18 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0354  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  47.37 
 
 
528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00285  DNA-binding transcriptional activator  47.18 
 
 
528 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00289  hypothetical protein  47.18 
 
 
528 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  47.18 
 
 
528 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3294  Fis family proprionate catabolism activator  47.18 
 
 
528 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0361  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  47.18 
 
 
528 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.785854  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0396  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  46.89 
 
 
528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0461  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  46.17 
 
 
541 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0407  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  45.79 
 
 
541 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0419  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  45.79 
 
 
541 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530564  normal  0.0144123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  45.61 
 
 
541 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5390  Fis family proprionate catabolism activator  43.72 
 
 
660 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420192  normal  0.577921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4843  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.58 
 
 
660 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418321  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0140  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.2 
 
 
660 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  43.48 
 
 
662 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3286  Fis family proprionate catabolism activator  42.62 
 
 
660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749536  normal  0.0314954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.48 
 
 
662 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.48 
 
 
662 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6705  Fis family proprionate catabolism activator  48.15 
 
 
656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344475  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  48.65 
 
 
659 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.54 
 
 
651 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191772  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5404  proprionate catabolism activator, Fis family  46.36 
 
 
678 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000463562  normal  0.497573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3862  proprionate catabolism activator, Fis family  47.56 
 
 
648 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3976  proprionate catabolism activator, Fis family  47.56 
 
 
648 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.966242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1204  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.27 
 
 
676 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000134686  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6082  proprionate catabolism activator, Fis family  43.59 
 
 
663 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.59 
 
 
663 aa  257  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  45.99 
 
 
633 aa  257  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0387  proprionate catabolism activator, Fis family  46.25 
 
 
652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.31 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.23 
 
 
575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2790  sigma-54 dependent sensory box protein  45.06 
 
 
650 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  42.07 
 
 
662 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0385  proprionate catabolism activator, Fis family  45.09 
 
 
658 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.62 
 
 
651 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  43.09 
 
 
639 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02702  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.9 
 
 
592 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02664  hypothetical protein  42.9 
 
 
592 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  44.14 
 
 
663 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4159  sigma-54 dependent transcriptional regulator, Fis family  44.51 
 
 
592 aa  250  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.778459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3002  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.2 
 
 
592 aa  250  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.59 
 
 
592 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0839  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.59 
 
 
592 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0823  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 
592 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0123  putative propionate catabolism operon regulatory transcription regulator protein  47.11 
 
 
649 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.323531  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2190  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.96 
 
 
735 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36000  propionate catabolism operon regulator  45.17 
 
 
473 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0249569  hitchhiker  0.000000000000235786 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0880  propionate catabolism operon regulatory protein  44.38 
 
 
694 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1871  propionate catabolism operon regulatory protein  44.38 
 
 
694 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3194  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.28 
 
 
592 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0287  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.38 
 
 
694 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1167  propionate catabolism operon regulatory protein  44.38 
 
 
686 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2144  propionate catabolism operon regulatory protein  44.38 
 
 
694 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0125  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.44 
 
 
477 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.261206  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1734  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.01 
 
 
697 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2878  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.98 
 
 
648 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.866934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3582  Fis family proprionate catabolism activator  46.97 
 
 
681 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181537  normal  0.0169262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.15 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0381  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.65 
 
 
703 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4093  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.11 
 
 
457 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3682  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.93 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3577  putative sigma54 specific transcriptional regulator  46.06 
 
 
550 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.01 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4292  transcriptional regulator  44.97 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964315  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.83 
 
 
480 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3199  Fis family transcriptional regulator  45.6 
 
 
520 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  43.3 
 
 
586 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1966  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.25 
 
 
526 aa  243  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.9 
 
 
636 aa  243  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0088  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.92 
 
 
459 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.18 
 
 
453 aa  243  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.11 
 
 
451 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.44 
 
 
643 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0125  response regulator receiver protein  44.73 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0083  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.05 
 
 
476 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.701237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.19 
 
 
441 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0709  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.3 
 
 
642 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  0.481573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0812  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.3 
 
 
642 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.03 
 
 
463 aa  240  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3916  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  45.69 
 
 
462 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000203856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4718  sigma-54 dependent response regulator  43.73 
 
 
460 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4316  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.05 
 
 
460 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.876739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4261  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.05 
 
 
460 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4456  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.05 
 
 
460 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0769  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.3 
 
 
642 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.989517  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0695  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.3 
 
 
642 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2160  two component signal transduction response regulator  46.43 
 
 
451 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000278347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3873  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.73 
 
 
476 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3966  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.73 
 
 
476 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.94 
 
 
690 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.72 
 
 
489 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.72 
 
 
489 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.78 
 
 
454 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4608  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.29 
 
 
666 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.74 
 
 
447 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4076  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.73 
 
 
460 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.311151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2669  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.25 
 
 
439 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>