More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0396 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00285  DNA-binding transcriptional activator  98.48 
 
 
528 aa  1065    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3276  proprionate catabolism activator, Fis family  98.48 
 
 
528 aa  1066    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00289  hypothetical protein  98.48 
 
 
528 aa  1065    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0407  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  79.43 
 
 
541 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3294  Fis family proprionate catabolism activator  98.67 
 
 
528 aa  1067    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0396  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  100 
 
 
528 aa  1080    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0419  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  79.66 
 
 
541 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530564  normal  0.0144123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0361  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  98.48 
 
 
528 aa  1066    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.785854  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  78.9 
 
 
541 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0354  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  98.3 
 
 
528 aa  1064    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  99.05 
 
 
528 aa  1072    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0461  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  78.91 
 
 
541 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3031  putative sigma54 specific transcriptional regulator  46.48 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265414  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02717  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  46.89 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4843  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.52 
 
 
660 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5390  Fis family proprionate catabolism activator  47.23 
 
 
660 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420192  normal  0.577921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6705  Fis family proprionate catabolism activator  48.81 
 
 
656 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344475  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  42.82 
 
 
639 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0140  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.65 
 
 
660 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0123  putative propionate catabolism operon regulatory transcription regulator protein  46.87 
 
 
649 aa  280  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.323531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0387  proprionate catabolism activator, Fis family  47.18 
 
 
652 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3976  proprionate catabolism activator, Fis family  47.18 
 
 
648 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.966242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3862  proprionate catabolism activator, Fis family  47.18 
 
 
648 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  50.62 
 
 
659 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3286  Fis family proprionate catabolism activator  47.52 
 
 
660 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749536  normal  0.0314954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  46.53 
 
 
662 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0385  proprionate catabolism activator, Fis family  46.36 
 
 
658 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  44.76 
 
 
633 aa  276  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4292  transcriptional regulator  45.76 
 
 
645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964315  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.38 
 
 
662 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.38 
 
 
662 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5404  proprionate catabolism activator, Fis family  44.82 
 
 
678 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000463562  normal  0.497573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.46 
 
 
651 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  43.32 
 
 
663 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.11 
 
 
651 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191772  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2878  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.29 
 
 
648 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.866934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.72 
 
 
643 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2190  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.95 
 
 
735 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2790  sigma-54 dependent sensory box protein  41.81 
 
 
650 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.95 
 
 
636 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36000  propionate catabolism operon regulator  42.16 
 
 
473 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0249569  hitchhiker  0.000000000000235786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6082  proprionate catabolism activator, Fis family  44.44 
 
 
663 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.09 
 
 
663 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1966  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.74 
 
 
628 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1204  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.71 
 
 
676 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000134686  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2075  sigma-54 dependent transcriptional regulator  41.3 
 
 
455 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1167  propionate catabolism operon regulatory protein  42.78 
 
 
686 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1871  propionate catabolism operon regulatory protein  42.78 
 
 
694 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0287  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  42.78 
 
 
694 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0880  propionate catabolism operon regulatory protein  42.78 
 
 
694 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2144  propionate catabolism operon regulatory protein  42.78 
 
 
694 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  47.9 
 
 
453 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1734  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  42.46 
 
 
697 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  38.02 
 
 
662 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2181  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.64 
 
 
594 aa  256  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000200827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0381  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  51.59 
 
 
703 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3582  Fis family proprionate catabolism activator  43.42 
 
 
681 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181537  normal  0.0169262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.75 
 
 
460 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3581  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.87 
 
 
467 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.02 
 
 
458 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 
687 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2392  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  44.79 
 
 
652 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1014  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.57 
 
 
645 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1264  Fis family transcriptional regulator  43.9 
 
 
582 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.645748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2645  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.12 
 
 
553 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2836  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.12 
 
 
553 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2842  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.12 
 
 
553 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000148111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.18 
 
 
471 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.91 
 
 
690 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2848  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.28 
 
 
553 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0615513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2865  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.12 
 
 
553 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0882219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2561  sigma-54-dependent transcriptional activator  42.12 
 
 
553 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.47 
 
 
558 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  43.28 
 
 
671 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2887  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.12 
 
 
553 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.11 
 
 
592 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2445  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.98 
 
 
553 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210628  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.75 
 
 
457 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.95 
 
 
591 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.34 
 
 
470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0777  putative sigma54 specific transcriptional regulator  48.67 
 
 
674 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.022498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 
453 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2596  sigma-54-dependent transcriptional activator  41.82 
 
 
553 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.491073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.33 
 
 
690 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1746  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
563 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.76 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.28 
 
 
690 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2930  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.03 
 
 
457 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.55 
 
 
690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3097  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.87 
 
 
427 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.28 
 
 
704 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2639  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.39 
 
 
553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1544  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.27 
 
 
568 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.11 
 
 
456 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.27 
 
 
690 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>