More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2190 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0880  propionate catabolism operon regulatory protein  94.68 
 
 
694 aa  1175    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3862  proprionate catabolism activator, Fis family  65.51 
 
 
648 aa  799    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0123  putative propionate catabolism operon regulatory transcription regulator protein  65.27 
 
 
649 aa  807    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.323531  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1871  propionate catabolism operon regulatory protein  94.68 
 
 
694 aa  1175    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  76.77 
 
 
662 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2144  propionate catabolism operon regulatory protein  93.78 
 
 
694 aa  1184    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5390  Fis family proprionate catabolism activator  76.47 
 
 
660 aa  974    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420192  normal  0.577921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0287  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  94.53 
 
 
694 aa  1175    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1734  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  94.12 
 
 
697 aa  1174    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0140  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  77.53 
 
 
660 aa  982    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0381  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  93.7 
 
 
703 aa  1174    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385394  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2190  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  100 
 
 
735 aa  1442    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3286  Fis family proprionate catabolism activator  76.92 
 
 
660 aa  965    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749536  normal  0.0314954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  67.46 
 
 
663 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  76.6 
 
 
662 aa  943    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6705  Fis family proprionate catabolism activator  66.01 
 
 
656 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344475  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3976  proprionate catabolism activator, Fis family  65.51 
 
 
648 aa  799    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.966242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4843  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  76.47 
 
 
660 aa  973    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418321  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1167  propionate catabolism operon regulatory protein  94.47 
 
 
686 aa  1157    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  76.6 
 
 
662 aa  943    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6082  proprionate catabolism activator, Fis family  67.35 
 
 
663 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  47.55 
 
 
663 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  48.63 
 
 
633 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2878  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.81 
 
 
648 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.866934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.33 
 
 
651 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0387  proprionate catabolism activator, Fis family  44.68 
 
 
652 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0385  proprionate catabolism activator, Fis family  44.02 
 
 
658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5404  proprionate catabolism activator, Fis family  42.98 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000463562  normal  0.497573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4292  transcriptional regulator  41.96 
 
 
645 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964315  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.96 
 
 
651 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191772  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  41.87 
 
 
659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1204  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.79 
 
 
676 aa  452  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000134686  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3582  Fis family proprionate catabolism activator  41.58 
 
 
681 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181537  normal  0.0169262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2790  sigma-54 dependent sensory box protein  41.16 
 
 
650 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  37.73 
 
 
639 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36000  propionate catabolism operon regulator  45.16 
 
 
473 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0249569  hitchhiker  0.000000000000235786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.44 
 
 
636 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2722  sigma-54 factor, interaction region  33.58 
 
 
628 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.351091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1966  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.72 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  36.82 
 
 
586 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  37.1 
 
 
662 aa  292  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.41 
 
 
703 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0289  Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 
633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.91 
 
 
661 aa  287  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0461  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.42 
 
 
541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0419  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.68 
 
 
541 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530564  normal  0.0144123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0354  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.65 
 
 
528 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00285  DNA-binding transcriptional activator  44.65 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00289  hypothetical protein  44.65 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.91 
 
 
597 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3294  Fis family proprionate catabolism activator  44.65 
 
 
528 aa  283  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3276  proprionate catabolism activator, Fis family  44.39 
 
 
528 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.65 
 
 
528 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0407  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.16 
 
 
541 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0396  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.62 
 
 
528 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0361  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  44.39 
 
 
528 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.785854  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.9 
 
 
541 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0709  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.5 
 
 
642 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  0.481573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.13 
 
 
643 aa  280  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0812  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.69 
 
 
642 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.1 
 
 
482 aa  279  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3656  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.03 
 
 
642 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0769  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.5 
 
 
642 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.989517  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0695  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.5 
 
 
642 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.84 
 
 
541 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.45 
 
 
539 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3581  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.85 
 
 
467 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  37.66 
 
 
527 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.09 
 
 
591 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  38.03 
 
 
582 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.04 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3308  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.35 
 
 
548 aa  271  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2392  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.55 
 
 
652 aa  270  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.53 
 
 
592 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.44 
 
 
585 aa  270  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.43 
 
 
687 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.69 
 
 
690 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.15 
 
 
470 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.04 
 
 
655 aa  267  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2075  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.84 
 
 
455 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4358  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.7 
 
 
492 aa  267  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4047  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.33 
 
 
486 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  37.8 
 
 
668 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  37.8 
 
 
668 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  39.06 
 
 
935 aa  266  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.1 
 
 
453 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0777  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.96 
 
 
674 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.022498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.29 
 
 
446 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.34 
 
 
591 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.62 
 
 
688 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.7 
 
 
690 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.7 
 
 
690 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.7 
 
 
690 aa  264  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.7 
 
 
690 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  37.14 
 
 
696 aa  264  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.7 
 
 
690 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.45 
 
 
690 aa  263  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2029  hypothetical protein  34.47 
 
 
554 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.9 
 
 
690 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.28 
 
 
468 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>