34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0793 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  60.51 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  64.34 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  53.46 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  54.84 
 
 		 172 aa  187  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  56.1 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  46.79 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  36.92 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  32.92 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  32.53 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  31.03 
 
 		 364 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  35.38 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  33.59 
 
 		 378 aa  67  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  37.5 
 
 		 918 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  33.04 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  30.28 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  26.11 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.71 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  29.84 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  30.89 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  26.76 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.84 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  30.16 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  29.84 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  30.71 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  26.62 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  28.57 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  27.34 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  26.83 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  28.32 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  28.33 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>