88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4450 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  100 
 
 		 162 aa  338  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  72.84 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  70.99 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  65.43 
 
 		 162 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  62.96 
 
 		 163 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  62.35 
 
 		 163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  63.86 
 
 		 166 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  69.85 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  60.49 
 
 		 163 aa  203  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  59.88 
 
 		 163 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  55.56 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  62.96 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  62.35 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  53.54 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  46.36 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  43.48 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  43.31 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  47.5 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  45.38 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  45.38 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  35.22 
 
 		 181 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  34.21 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  42.37 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  37.4 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  33.13 
 
 		 193 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  37.76 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  37.06 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  37.06 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  34.87 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  34.87 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  38.98 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  34.25 
 
 		 191 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  34.03 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  34.42 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.1 
 
 		 193 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  36.72 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  36.72 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  36.72 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  36.72 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  32.48 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  29.27 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  28.66 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  32.61 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  36.8 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  30.25 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  32.8 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  38.46 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  36.36 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  26.24 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.89 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  28.3 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  25.62 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  29.37 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  25.58 
 
 		 364 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.01 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.8 
 
 		 364 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  23.6 
 
 		 378 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  27.46 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  25.48 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  26.4 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  23.64 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  25 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  22.49 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  25.81 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  24.19 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  44.64 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  24.44 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  24.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  35.85 
 
 		 651 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  24.29 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  26.12 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  26.14 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  22 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  24.52 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  27.74 
 
 		 918 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  25.49 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  25.49 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  32.1 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  26.19 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>