85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0488 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  100 
 
 		 166 aa  345  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  76.51 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  75.17 
 
 		 162 aa  237  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  65.66 
 
 		 162 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  63.86 
 
 		 162 aa  224  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  63.86 
 
 		 162 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  62.65 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  63.25 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  61.45 
 
 		 163 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  60.24 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  63.25 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  63.25 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  50 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  47.47 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  47.3 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  48.75 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  41.21 
 
 		 196 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  40.29 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  40.65 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  40.65 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  41.33 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  39.16 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  38.18 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  40.67 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  41.91 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  41.03 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  41.03 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  39.55 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  38.97 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  39.42 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  35.29 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  35.25 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  38.46 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  38.46 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  38.46 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  31.55 
 
 		 193 aa  91.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  33.12 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  41.94 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  31.71 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.1 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  33.96 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  32.08 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  38.02 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  39.53 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  32.53 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  36.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  33.87 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  27.4 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  31.48 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.93 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.03 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  31.76 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  24.84 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  29.69 
 
 		 364 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  28.03 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  27.81 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  25.56 
 
 		 364 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  25.6 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.41 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  27.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  25.74 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  25.61 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  28.87 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  24.52 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  25.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  23.42 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  25.93 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  26.9 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  23.87 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  26.57 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  25.93 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  25.93 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  25.47 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  27.22 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  27.85 
 
 		 350 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  23.08 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  23.87 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>