79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3203 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3203  NosL  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  64.85 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  60.54 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  60.54 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  65.52 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  64.75 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  64.75 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  64.75 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  64.75 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  57.14 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  53.93 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  56.77 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  56.77 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  62.25 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  53.12 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  64.84 
 
 		 103 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  40.79 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  42.68 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  43.92 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  40.51 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  43.17 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  39.16 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  35.58 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  38.78 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  36.81 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  38.78 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  41.13 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  35.37 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  41.32 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  39.42 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  34.16 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  37.76 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  37.41 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  39.85 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  36.05 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  38.1 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  36.25 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  35.62 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  37.41 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  37.59 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  33.85 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  36.3 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  33.54 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  32.7 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  32.9 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  28.75 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  35.62 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  33.33 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  34.44 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  29.14 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  28.92 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  32.81 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  29.93 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  33.87 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  35.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  29.68 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  27.71 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.31 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  29.2 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.38 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  29.92 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  32 
 
 		 364 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  30.3 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  32.26 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  30.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  30.66 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.67 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  30.28 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  28.35 
 
 		 350 aa  45.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  24.37 
 
 		 672 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  26.36 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  25.9 
 
 		 378 aa  44.3  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  30.53 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  26.12 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>