79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0697 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  100 
 
 
350 aa  729    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  42.94 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  40.97 
 
 
378 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  40.88 
 
 
364 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  45.54 
 
 
232 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  50.79 
 
 
131 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  55.08 
 
 
152 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  50 
 
 
156 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  45.31 
 
 
163 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  46.09 
 
 
165 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  45.16 
 
 
170 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  41.84 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  45.38 
 
 
160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  42.28 
 
 
160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  41.13 
 
 
162 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  43.97 
 
 
162 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  43.28 
 
 
158 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  40.69 
 
 
918 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  35.94 
 
 
156 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  32.53 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  33.59 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  32.06 
 
 
170 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  33.08 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  32.58 
 
 
199 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  29.85 
 
 
172 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  30.19 
 
 
182 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  30.19 
 
 
182 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  30.89 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  27.4 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  29.23 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  29.23 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  33.04 
 
 
119 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  29.25 
 
 
181 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  33.09 
 
 
203 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  25.15 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  27.27 
 
 
178 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  28.23 
 
 
163 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  32.52 
 
 
185 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  27.42 
 
 
163 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  29.17 
 
 
163 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  29.06 
 
 
179 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  26.52 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  29.06 
 
 
179 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  32.61 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  26.92 
 
 
181 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  23.38 
 
 
162 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  26.92 
 
 
180 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  30.56 
 
 
172 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  29.25 
 
 
181 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  25 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  39.71 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  28.81 
 
 
168 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  39.71 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  31.45 
 
 
205 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  28.23 
 
 
193 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  44.9 
 
 
181 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  25.69 
 
 
163 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  27.27 
 
 
228 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  26.38 
 
 
167 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  38.24 
 
 
176 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  38.24 
 
 
176 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  26.9 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  31.62 
 
 
188 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  24.44 
 
 
162 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  28.46 
 
 
180 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  24.41 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  28.68 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  28.35 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  28.87 
 
 
183 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  25.78 
 
 
167 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  31.36 
 
 
173 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  24.44 
 
 
197 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  23.33 
 
 
173 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>