75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1734 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  98.31 
 
 
178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  49.36 
 
 
196 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  44.79 
 
 
162 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  50 
 
 
173 aa  131  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  39.13 
 
 
162 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  42.59 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  40.99 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  41.1 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  48.41 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  40.37 
 
 
162 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  42.47 
 
 
163 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  42.47 
 
 
163 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  40.61 
 
 
180 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  43.17 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  41.1 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  41.1 
 
 
163 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  40.34 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  40.41 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  41.61 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  40.67 
 
 
166 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  43.97 
 
 
173 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  40.99 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  42.11 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  42.11 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  41.06 
 
 
181 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  41.09 
 
 
171 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  38.18 
 
 
176 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  45.08 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  45.08 
 
 
176 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  45.08 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  45.08 
 
 
176 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  40.51 
 
 
191 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  40.15 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  33.7 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  36.6 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  37.09 
 
 
176 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  37.09 
 
 
176 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  35.95 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  33.95 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  33.33 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  36.42 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  40.14 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  33.56 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  31.54 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  40 
 
 
103 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  29.38 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  33.59 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  34.15 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  35.16 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  34.38 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  24.82 
 
 
364 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  32.03 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  30.19 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  33.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  33.59 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  31.48 
 
 
210 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  25.49 
 
 
350 aa  51.6  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  22.31 
 
 
364 aa  51.2  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  26.67 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  26 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.75 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  30.19 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  23.57 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  28.67 
 
 
162 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  24.86 
 
 
189 aa  48.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.16 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  27.21 
 
 
378 aa  47.8  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  21.77 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  26.9 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  27.14 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  27.52 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  27.78 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  28.45 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>