80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1134 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  63.87 
 
 		 191 aa  235  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  65.85 
 
 		 173 aa  224  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  58.86 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  58.66 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  60.54 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  61.78 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  61.78 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  57.96 
 
 		 176 aa  200  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  51.7 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  51.7 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  51.7 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  51.7 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  78.26 
 
 		 103 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  58.45 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  38.04 
 
 		 196 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  39.74 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  38.86 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  38.96 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  43.38 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  39.16 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  38.89 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  37.5 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  38.3 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  38.82 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  39.6 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  36.81 
 
 		 163 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  36.81 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  41.33 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  35.85 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  40.67 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  39.86 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  34.83 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  36.81 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  36.81 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  34.87 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  36.77 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  38.13 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  31.87 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  34.93 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  33.33 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  32.73 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.67 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  40 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  32.7 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  30.56 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  36.3 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  31.69 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  30.06 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  39.66 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  28.19 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.68 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  30.19 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  27.1 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  24.47 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  28.35 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  54.7  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  30.47 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  28.74 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  34.35 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  34.71 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  26.95 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.48 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  34.35 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  29.06 
 
 		 672 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  27.88 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  48.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  31.5 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  31.5 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  30.08 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  26.47 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  31.71 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  44.19 
 
 		 651 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  22.7 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  29.37 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  33.77 
 
 		 638 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  47.92 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  44 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>