85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3871 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  100 
 
 
163 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  93.87 
 
 
163 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  94.48 
 
 
163 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  96.32 
 
 
163 aa  291  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  88.34 
 
 
163 aa  290  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  88.34 
 
 
163 aa  290  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  62.35 
 
 
162 aa  227  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  64.2 
 
 
162 aa  227  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  62.96 
 
 
162 aa  227  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  64.81 
 
 
162 aa  223  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  69.4 
 
 
162 aa  203  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  55.62 
 
 
162 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  63.25 
 
 
166 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  46.79 
 
 
165 aa  160  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  47.4 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  44.06 
 
 
173 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  42.86 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  41.55 
 
 
180 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  41.78 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  41.78 
 
 
178 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  40.38 
 
 
181 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  36.77 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  36.77 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  33.97 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  39.68 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  34.36 
 
 
193 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  37.01 
 
 
176 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  39.37 
 
 
181 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  37.42 
 
 
181 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  37.04 
 
 
180 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  36.89 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  36.89 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  35.26 
 
 
191 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  36.07 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  35.19 
 
 
179 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  34.57 
 
 
179 aa  94.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  39.84 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  39.84 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  38.4 
 
 
191 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  39.37 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  39.02 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  39.02 
 
 
176 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.62 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  34.9 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  31.58 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  40.94 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  37.08 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  37.4 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  31.06 
 
 
364 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  35.83 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  28.57 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  35.48 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  28.86 
 
 
378 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  29.08 
 
 
205 aa  58.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  26.71 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  27.78 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  28.67 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.69 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  26.76 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  27.74 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  29.69 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.46 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  30.82 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  28.15 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  36 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  29.69 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  30.94 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  43.4 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  28.91 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.13 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.37 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  25.64 
 
 
350 aa  47.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  28.93 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  27.27 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  26.09 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  39.22 
 
 
711 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  28.78 
 
 
918 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  25.17 
 
 
172 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  29.85 
 
 
222 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  26 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  29.91 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  25.33 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  36.96 
 
 
638 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  26.03 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>