288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1256 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  40.88 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  45.61 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  43.86 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  44.07 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  50 
 
 		 362 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  48.08 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  47.27 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  48.08 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  53.57 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  43.33 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  41.94 
 
 		 250 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  50 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  45.28 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  45.76 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  45.76 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  49.06 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  40 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  39.74 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  43.4 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  40.68 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  43.4 
 
 		 354 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  46 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 		 256 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  41.82 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  48.21 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  36.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 254 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  35.79 
 
 		 254 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0545  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  48.08 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  43.64 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  41.18 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  48.89 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.16 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  46.15 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  40.68 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  42.37 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  42.37 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  42.59 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  43.64 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  41.38 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  30.16 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  40.35 
 
 		 424 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  46 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  44.64 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  32.86 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  32.86 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 275 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  48.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  41.94 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  27.2 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  27.2 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  27.2 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  27.2 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>