56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1308 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  38.1 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  35.07 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  31.08 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  34.85 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  33.58 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  33.85 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  36.36 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  36.15 
 
 
364 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  35.94 
 
 
350 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  30.65 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  32.85 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  30.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  36.07 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  30.52 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  30.65 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  30.65 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  29.84 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  29.84 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  29.14 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  29.03 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  30.95 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  30.95 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  30.95 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  29.37 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  28.32 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  28.23 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  34.86 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  29.22 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  26.72 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  44.44 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  27.91 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  33.01 
 
 
163 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  34.95 
 
 
163 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  27.91 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  26.8 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  26.92 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  40.74 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  29.2 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  28.91 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  31.37 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  39.34 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  38.89 
 
 
173 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  26.12 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  19.15 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  32.1 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  46 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  40 
 
 
651 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  29.47 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  46.34 
 
 
711 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  30.39 
 
 
180 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>