64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1054 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  99.02 
 
 
204 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  57.89 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  48.59 
 
 
199 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  55 
 
 
181 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  48.97 
 
 
200 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  48.97 
 
 
200 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  37.29 
 
 
131 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  33.6 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  40.98 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  35.37 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  40.98 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  33.33 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  40.62 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  38.46 
 
 
162 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  34.62 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  32.41 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  28.57 
 
 
364 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  32.85 
 
 
364 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  28.95 
 
 
350 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  26.76 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  43.24 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  26.24 
 
 
378 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  33.12 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  31.43 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  32.39 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  31.97 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  28.86 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  29.17 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  31.71 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  32.14 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  32.5 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  32.14 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  29.8 
 
 
166 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.5 
 
 
173 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  33.33 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  31.54 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  29.45 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  26.85 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  27.46 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  31.06 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  27.07 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  32.31 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  28.57 
 
 
152 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  28.66 
 
 
179 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  27.54 
 
 
162 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  28.46 
 
 
165 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  28.05 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  30.7 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  32.61 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  30.26 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  27.01 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  30.5 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  31.06 
 
 
176 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  30.41 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  25.49 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  31.85 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  38.46 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  28.93 
 
 
232 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  29.51 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  43.9 
 
 
158 aa  41.6  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>