38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1552 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  45.54 
 
 
350 aa  154  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  39.91 
 
 
378 aa  147  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  39.15 
 
 
364 aa  146  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  38.1 
 
 
364 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  46.53 
 
 
918 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  44.3 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  33.86 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  38.39 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  33.86 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  35.38 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  28.3 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  29.52 
 
 
165 aa  55.5  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 
203 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 
201 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  32.58 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  30.58 
 
 
167 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  44.64 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  38.46 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  28.87 
 
 
166 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  36.84 
 
 
162 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1306  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0193608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  25.25 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  27.13 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  27.2 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  27.59 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  42 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  27.59 
 
 
171 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  29.06 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  26.28 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  37.25 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  37.25 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  41.67 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
194 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>