76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1373 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  76.14 
 
 		 176 aa  283  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  76.7 
 
 		 176 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  76.7 
 
 		 176 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  55.75 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  55.75 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  55.41 
 
 		 173 aa  190  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  53.3 
 
 		 191 aa  187  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  55.75 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  52.66 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  48.59 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  48.59 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  48.59 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  66.3 
 
 		 103 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  48.03 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  39.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  38.85 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  35.42 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  33.95 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  40 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  37.7 
 
 		 163 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  37.4 
 
 		 162 aa  97.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  37.7 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  35.25 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  37.5 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  34.23 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  35.46 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  38.52 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  38.98 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  36.07 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  37.5 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  36.81 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  33.61 
 
 		 163 aa  87.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  36.07 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  35.29 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  31.52 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  35.25 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  31.21 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  33.1 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  36.67 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  28.25 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  31.08 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  29.52 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  30.13 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  30.13 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  28.75 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  34.93 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  30.82 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.56 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  24.34 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  29.03 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.36 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  27.56 
 
 		 131 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.69 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  29.69 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  29.27 
 
 		 364 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.49 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  31.97 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  28.91 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  25.25 
 
 		 232 aa  44.3  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  26.12 
 
 		 364 aa  44.3  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.37 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  25.29 
 
 		 672 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.85 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  25.19 
 
 		 151 aa  42  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  22.93 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  29.08 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  29.08 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  24.43 
 
 		 350 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  31.37 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  22.16 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>