70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2857 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  62.21 
 
 
181 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  58.28 
 
 
179 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  57.67 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  60 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  52.81 
 
 
181 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  57.69 
 
 
183 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  55.62 
 
 
181 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  49.37 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  43.51 
 
 
191 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  45.18 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  36.59 
 
 
173 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  35 
 
 
180 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  36.44 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  37.14 
 
 
173 aa  91.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  34.46 
 
 
163 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  34.46 
 
 
163 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  33.12 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  33.53 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  36.13 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  33.94 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  35.48 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  33.11 
 
 
163 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  33.55 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  33.11 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  33.77 
 
 
196 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  32.1 
 
 
162 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  32.5 
 
 
182 aa  84.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  32.5 
 
 
182 aa  84.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  33.33 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  31.25 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  33.14 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  29.27 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  32.86 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  29.94 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  36 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  33.9 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  33.78 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  33.1 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  33.1 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  33.11 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  33.77 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  33.1 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  33.1 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  33.77 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  36.43 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  29.11 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  30.56 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  29.66 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  31.43 
 
 
103 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  26.74 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  30.72 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  41.89 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.88 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.79 
 
 
364 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  33.54 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  41.89 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  26.83 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  33.08 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  31.2 
 
 
131 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  33.06 
 
 
170 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  28.78 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  28.23 
 
 
350 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  38.67 
 
 
672 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  31.45 
 
 
163 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  26.83 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  36.59 
 
 
638 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  32.26 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  43.33 
 
 
711 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  37.18 
 
 
651 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>