71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1081 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  100 
 
 
181 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  48.88 
 
 
193 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  41.57 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  38.22 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  40.37 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  41.48 
 
 
163 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  36.48 
 
 
162 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  37.89 
 
 
162 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  41.48 
 
 
163 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  41.6 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  41.6 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  35.22 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  43.26 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  40 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  37.58 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  43.51 
 
 
178 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  40.8 
 
 
162 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  40.74 
 
 
163 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  40 
 
 
163 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  33.78 
 
 
180 aa  101  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  34.83 
 
 
182 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  34.83 
 
 
182 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  33.12 
 
 
165 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  34.16 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  34.94 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  33.83 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  37.58 
 
 
191 aa  88.2  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.52 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  41.23 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  41.23 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  41.23 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  41.23 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  33.95 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  33.95 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  34.48 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  39.83 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  38.1 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  29.68 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  32.86 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  32.14 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  29.67 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  29.56 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  29.7 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  29.27 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  27.22 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  26.58 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  34.75 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  29.11 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  26.67 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  31.54 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  29.1 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  27.08 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  26.49 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  22.86 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  27.61 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  27.69 
 
 
364 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  27.85 
 
 
205 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  28.28 
 
 
210 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  26.92 
 
 
350 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  26.63 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.54 
 
 
162 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  24.6 
 
 
378 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  27.27 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  24.19 
 
 
131 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  26.58 
 
 
152 aa  44.3  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  29.37 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  24.24 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  24.85 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  22.22 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  28.8 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>