64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1397 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  51.83 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  48.59 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  48.02 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  46.84 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  43.2 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  42.08 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  42.08 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  38.14 
 
 		 131 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  38.12 
 
 		 162 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  34.38 
 
 		 160 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  40 
 
 		 163 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  36.5 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  38.4 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  36.15 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  34.4 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  37.6 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.81 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  30.83 
 
 		 364 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  29.51 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  28.12 
 
 		 364 aa  62  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  33.33 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  30.67 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  29.91 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  28.46 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.63 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  32.84 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  27.74 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  31.82 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  35 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  28.78 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  22.39 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  28.36 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  26.92 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  27.61 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  30 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  31.43 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  26.28 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  30.71 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  19.83 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.58 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  31.58 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  31.58 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  29.37 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  26.77 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  26.15 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  26.87 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  27.52 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  24.58 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  23.73 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  21.01 
 
 		 167 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  21.19 
 
 		 167 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  27.52 
 
 		 178 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  21.19 
 
 		 167 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  21.19 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  27.08 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>