26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0502 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  47.83 
 
 
918 aa  128  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  44.3 
 
 
232 aa  120  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  43.28 
 
 
350 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  43.51 
 
 
364 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  40.13 
 
 
364 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  41.98 
 
 
378 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  35.25 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  32.52 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  32.58 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  34.11 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  33.93 
 
 
119 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 
203 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  32.28 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  33.06 
 
 
184 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  25.93 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  28.57 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  29.85 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  26.8 
 
 
196 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  25.16 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  29.32 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  28.45 
 
 
173 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  43.9 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  43.9 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>