74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2169 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  781    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  47.76 
 
 
364 aa  335  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  47.99 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  41.24 
 
 
350 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  39.91 
 
 
232 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  43.85 
 
 
131 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  46.34 
 
 
162 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  43.38 
 
 
160 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  48.41 
 
 
156 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  45.31 
 
 
162 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  44.53 
 
 
162 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  37.95 
 
 
160 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  42.19 
 
 
163 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  42.97 
 
 
165 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  42.19 
 
 
170 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  41.22 
 
 
918 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  44.62 
 
 
152 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  33.85 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  32.82 
 
 
170 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.53 
 
 
210 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  36.09 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  37.96 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  31.18 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  34.35 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  33.59 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  32.59 
 
 
222 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  27.56 
 
 
167 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  28.28 
 
 
162 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 
203 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  31.33 
 
 
163 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  29.53 
 
 
163 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  29.53 
 
 
163 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  26.24 
 
 
204 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  31.06 
 
 
196 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  29.91 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  28.17 
 
 
188 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  26.24 
 
 
204 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
201 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  28.15 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  28.15 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  28.47 
 
 
205 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  27.34 
 
 
165 aa  53.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  26.56 
 
 
171 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  27.46 
 
 
173 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  32.81 
 
 
176 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  32.81 
 
 
176 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  27.42 
 
 
181 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  23.6 
 
 
162 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  32.81 
 
 
176 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  32.81 
 
 
176 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  30.2 
 
 
163 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  25 
 
 
162 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  26.15 
 
 
181 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  28.86 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  29.13 
 
 
179 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  28.93 
 
 
180 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  27.33 
 
 
163 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  24.26 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  28.35 
 
 
179 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  26.62 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  24.81 
 
 
180 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  24.6 
 
 
181 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  29.37 
 
 
178 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  31.62 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  24.43 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  27.78 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  25.93 
 
 
166 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  25.9 
 
 
181 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  25.2 
 
 
191 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.97 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>