91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3360 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  100 
 
 
163 aa  342  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  90.8 
 
 
163 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  88.96 
 
 
163 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  87.73 
 
 
163 aa  290  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  90.18 
 
 
163 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  88.34 
 
 
163 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  61.73 
 
 
162 aa  224  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  62.96 
 
 
162 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  61.73 
 
 
162 aa  220  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  59.88 
 
 
162 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  68.66 
 
 
162 aa  200  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  61.45 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  53.75 
 
 
162 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  47.02 
 
 
165 aa  161  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  45.28 
 
 
196 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  44.06 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  45.22 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  40.14 
 
 
180 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  38.06 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  41.1 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  38.06 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  39.1 
 
 
181 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  40.41 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  41.27 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.26 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  40.16 
 
 
181 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  33.33 
 
 
193 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  36.55 
 
 
191 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  37.7 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  37.7 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  37.33 
 
 
181 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  35.8 
 
 
180 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  35 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  41.6 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  35.19 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  34.57 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  36.53 
 
 
181 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  40.65 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  40.65 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.62 
 
 
193 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  33.61 
 
 
176 aa  87  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  39.84 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  39.84 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  36.91 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  33.33 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  41.27 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.96 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  39.02 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  31.37 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  30.67 
 
 
364 aa  60.8  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  31.33 
 
 
378 aa  59.7  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  34.68 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.38 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  27.27 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.7 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  28.17 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  28.89 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.43 
 
 
204 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  26.71 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  28.89 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  27.75 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  28.95 
 
 
350 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  31.3 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  30.47 
 
 
364 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  29.77 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  29.5 
 
 
204 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  29.13 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.46 
 
 
170 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  29.01 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.08 
 
 
160 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  31.48 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  27.04 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  30.66 
 
 
918 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  44.44 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  26.87 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  39.62 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  26.28 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  26.28 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  39.22 
 
 
711 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  30.14 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  25.35 
 
 
210 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  34.43 
 
 
672 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  26 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  26 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  25.33 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  39.13 
 
 
638 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  26.67 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  26.67 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  26.67 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  25.33 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  27.48 
 
 
199 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>