83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1829 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  100 
 
 		 160 aa  333  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  60.87 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  47.4 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  45.57 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  50 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  47.33 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  46.97 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  45.38 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  46.15 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  45.24 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  41.91 
 
 		 364 aa  117  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  37.95 
 
 		 378 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  44.8 
 
 		 364 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  42.28 
 
 		 350 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  39.32 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  37.9 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  33.6 
 
 		 204 aa  84.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  34.38 
 
 		 199 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  33.6 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  40.19 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  40.19 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  31.45 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  27.78 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  31.5 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  31.85 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  28.38 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  31.78 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  29.23 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  30.83 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  29.01 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  33.64 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  30.83 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  29.03 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  29.58 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  30.08 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  30.08 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  29.48 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  24.82 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  29.48 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  29.77 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  27.01 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  29.17 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  25.64 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  25.45 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  27.98 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  31.45 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  31.45 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  26.63 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.71 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  31.71 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  25.71 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  30 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  29.56 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  26.79 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  27.69 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  23.24 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  28.24 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  24.85 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.85 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  28.76 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  28.76 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  22.54 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  30.77 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  45 
 
 		 672 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  30.89 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  22.76 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  22.76 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  29.63 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  29.12 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  26.32 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  28.26 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  21.83 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  25.9 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>