50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1929 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  38.18 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  37.61 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  34.55 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  32 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  32.7 
 
 
341 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  29.36 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  31.19 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  31.19 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  31.19 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  30.28 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  31.19 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  31.19 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  30.28 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  30.28 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  30.3 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  28.57 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1313  hypothetical protein  27.05 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2398  hypothetical protein  37.63 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0988059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  32.17 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1465  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  33.65 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1560  hypothetical protein  35.09 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0206822  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0579  hypothetical protein  34.06 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.461957  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  31.37 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  31.73 
 
 
222 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  32.35 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  34.41 
 
 
152 aa  50.8  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  31.82 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  31.09 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0248  hypothetical protein  35.65 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  31.09 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1940  hypothetical protein  28.37 
 
 
230 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1306  hypothetical protein  35.87 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0193608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2170  hypothetical protein  32.22 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.122889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  31.91 
 
 
350 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  29.17 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  29.37 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.33 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  31.73 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  29.92 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  29.82 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  27.56 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  29 
 
 
364 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  32.29 
 
 
364 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  28.46 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0580  hypothetical protein  26.57 
 
 
256 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  27.5 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  25.9 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  31.43 
 
 
228 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>