40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0694 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  700    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  41.24 
 
 
188 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  36.08 
 
 
199 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  38.54 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  38.54 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  42.95 
 
 
218 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  43.05 
 
 
228 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  38.46 
 
 
206 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  35.48 
 
 
157 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  32.9 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  30.5 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  28.76 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  28.91 
 
 
168 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  32.7 
 
 
160 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  25.79 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  28.68 
 
 
161 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1560  hypothetical protein  32.2 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0206822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0248  hypothetical protein  28.26 
 
 
147 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2398  hypothetical protein  31.36 
 
 
155 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0988059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1465  hypothetical protein  32.52 
 
 
155 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  29.24 
 
 
184 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  24.84 
 
 
260 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  23.2 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  24 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  23.2 
 
 
167 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  24 
 
 
167 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  23.02 
 
 
167 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1164  hypothetical protein  33.85 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.828155  normal  0.0879348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0684  hypothetical protein  30.4 
 
 
160 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1563  hypothetical protein  32.23 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0151315  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  21.55 
 
 
155 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1313  hypothetical protein  22.14 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>