75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3586 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  95.68 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  49.38 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  54.2 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  55 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  51.94 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  51.16 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  49.61 
 
 		 170 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  47.33 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  43.75 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  43.51 
 
 		 364 aa  123  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  44.53 
 
 		 378 aa  117  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  42.42 
 
 		 364 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  41.13 
 
 		 350 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  41.28 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  41.28 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  39.34 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  36.92 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  37.65 
 
 		 199 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  38.58 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  32.31 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  32.91 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  31.58 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  26.79 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  30.15 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  28.23 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  29.93 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  27.61 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  28.89 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  28.74 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  30.52 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  28.74 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  27.93 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  28.89 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  26.67 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  25.16 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  28.89 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  26.13 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  30.22 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  28.7 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  33.64 
 
 		 228 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  24.64 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  25.19 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  24.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  27.59 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  27.59 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  24.67 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  28.7 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  26.77 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  25.67 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  29.69 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  27.56 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  26.14 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  23.24 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  27.66 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  25.36 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  24.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  30.93 
 
 		 181 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>