72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1474 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  100 
 
 
156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  50.62 
 
 
162 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  49.38 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  53.85 
 
 
131 aa  161  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  56.25 
 
 
160 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  47.4 
 
 
160 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  52.67 
 
 
165 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  51.91 
 
 
163 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  51.18 
 
 
170 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  46.1 
 
 
162 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  50 
 
 
350 aa  127  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  41.89 
 
 
364 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  48.41 
 
 
378 aa  121  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  47.62 
 
 
364 aa  118  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  41.41 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  38.46 
 
 
222 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  38.4 
 
 
181 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  38.89 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  38.89 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  36.15 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  29.84 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  32.41 
 
 
204 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  32.41 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  28.93 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  29.22 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  28.24 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  27.74 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  30.53 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  30.53 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  29.92 
 
 
181 aa  53.9  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  28.3 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  35.71 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  35.71 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  35.71 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  27.82 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  29.01 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  25.48 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  29.13 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  27.07 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  28.68 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  30.34 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  27.41 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  28.1 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  35.82 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  27.27 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  28.21 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  28.33 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  26.72 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  30.08 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  26.28 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  30.08 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  30.08 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  26.57 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  27.05 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  25.68 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  29.06 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  25.9 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  25.68 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  28.46 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  29.92 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  21.64 
 
 
168 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  29.92 
 
 
178 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  35.71 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  25.32 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  28.7 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  29.01 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  24.07 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>