46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2354 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  61.9 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  40.19 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4176  hypothetical protein  37.58 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.99 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  30.33 
 
 
222 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  28.47 
 
 
378 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.89 
 
 
364 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.83 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  32.48 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.09 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  31.62 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  25.58 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  26.83 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  31.82 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  29.23 
 
 
131 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  31.62 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  31.45 
 
 
350 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  30.14 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  30.14 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  25.58 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  28.79 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  30.82 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  24.29 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  31.34 
 
 
152 aa  45.1  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  30.14 
 
 
163 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  26.36 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  23.5 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  20.86 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  31.58 
 
 
162 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  26.67 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  27.83 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  30.09 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  28 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  30.82 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  29.82 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.64 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  24.56 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  27.97 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  29.51 
 
 
204 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  28.68 
 
 
193 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  24.79 
 
 
165 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  45 
 
 
204 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  23.21 
 
 
168 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  19.15 
 
 
156 aa  42  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  26.19 
 
 
364 aa  42  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>