84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2215 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2215  NosL  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  62.5 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  61.24 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  51.85 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  43.48 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  44.52 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  43.45 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  44.29 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  43.24 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  43.57 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  43.57 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  42.65 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  41.22 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  40.71 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  40 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  40.29 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  42.14 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  41.43 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  46.09 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  39.73 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  45.31 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  38.86 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  38.86 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  40.6 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  37.14 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  36.42 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  40.15 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  36.91 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  36.67 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  36.67 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  35.58 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  41.61 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  41.61 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  41.61 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  41.61 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  35 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  33.78 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  42.16 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  42.34 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  33.33 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  31.21 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  35.59 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  33.1 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  33.1 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  36.76 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  36.03 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  34.17 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  36.08 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  25.77 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  26.35 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  31.06 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  26.79 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  26.79 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  28.1 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  33.33 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.25 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  29.6 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  26.09 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  30.65 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  30.77 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  30.53 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  27.82 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  26.92 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  27.13 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.98 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  24.81 
 
 		 378 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  24.56 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  25.55 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  24.46 
 
 		 364 aa  44.3  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  23.97 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  27.61 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  29.41 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  24.38 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  29.06 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  33.77 
 
 		 651 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  23.9 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  27.01 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>