59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1078 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  48.88 
 
 
181 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  43.35 
 
 
171 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  41.03 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  39.74 
 
 
178 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  41.13 
 
 
196 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  38.71 
 
 
162 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  34.97 
 
 
162 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  35.57 
 
 
163 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  35.57 
 
 
163 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  33.14 
 
 
162 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  34.36 
 
 
162 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  40.32 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  33.13 
 
 
162 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  34.39 
 
 
165 aa  98.6  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  33.33 
 
 
163 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  32.73 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  37.4 
 
 
163 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  36.64 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  42.16 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  35.51 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  31.61 
 
 
166 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  33.54 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  30.18 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  30.94 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  34.23 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  37.82 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  37.82 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  37.82 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  37.82 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  30 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  40.38 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  29.41 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  30.06 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  30.06 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  29.03 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  36.03 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  29.93 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  32.43 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  34.65 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.16 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  34.07 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  34.07 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  29.66 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  35.16 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  37.78 
 
 
103 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  27.88 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  32.81 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  25.9 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  27.27 
 
 
364 aa  52  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  29.01 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.04 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  27.62 
 
 
364 aa  45.1  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  28.36 
 
 
378 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.97 
 
 
162 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  29.31 
 
 
205 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.12 
 
 
160 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  26.67 
 
 
160 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>