78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0354 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  100 
 
 		 162 aa  343  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  58.49 
 
 		 162 aa  209  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  58.13 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  57.5 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  55.56 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  53.09 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  58.62 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  57.93 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  56.52 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  53.33 
 
 		 162 aa  183  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  59.59 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  61.07 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  50 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  46.9 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  45.45 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  43.45 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  38.61 
 
 		 196 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  42.76 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  42.07 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  39.02 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  37.89 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.67 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  37.74 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  35.85 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  35.85 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  38.4 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  39.33 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  35.37 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  33.14 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  45.3 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  45.3 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  44.54 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  44.54 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  39.84 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  39.84 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  38.52 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  39.34 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  41.88 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  34.64 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.91 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  34.18 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  33.54 
 
 		 179 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  43.33 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  32.69 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  40.5 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  37.01 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  38.46 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  33.12 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  27.63 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  37.5 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  28.28 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  25.32 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  27.4 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  23.03 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.89 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  23.38 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  25.16 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  25.81 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  23.65 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  25.44 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.06 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  31.06 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  27.41 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  24.6 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  26.47 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  19.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  25.38 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.69 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  25.95 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  26.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  32.81 
 
 		 651 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  24.05 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  27.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  26.77 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  29.55 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  29.47 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>