73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1478 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  63.87 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  63.87 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  55.17 
 
 		 176 aa  201  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  55.88 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  53.93 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  54.49 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  56.17 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  56.17 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  52.53 
 
 		 181 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  49.46 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  50 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  49.46 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  49.46 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  72.16 
 
 		 103 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  53.79 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  37.14 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  36.91 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  36.65 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  40.8 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  39.33 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  37.24 
 
 		 162 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  38.46 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  37.76 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  38.99 
 
 		 162 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  37.76 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  37.06 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  41.6 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  37.93 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  42.15 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  40 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  40 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  33.33 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  34.25 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  39.04 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  37.06 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  38.18 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  36.36 
 
 		 163 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  34.12 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  38.36 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  33.12 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  34.23 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  36.18 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  34.27 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  40.91 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  33.12 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  35.57 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  38.98 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  32.43 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.76 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  29.65 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.28 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  33.09 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  32.31 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  32.84 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  23.21 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  25.5 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  40.79 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  29.17 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.57 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  25.61 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  30.88 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  43.64 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  27.22 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  30.36 
 
 		 672 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  21.64 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.88 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  22.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  22.02 
 
 		 167 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>