87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4471 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  100 
 
 
162 aa  337  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  82.72 
 
 
162 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  75.9 
 
 
166 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  70.99 
 
 
162 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  68.52 
 
 
162 aa  243  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  66.05 
 
 
162 aa  231  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  64.2 
 
 
163 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  64.2 
 
 
163 aa  206  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  64.2 
 
 
163 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  63.58 
 
 
163 aa  203  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  64.81 
 
 
163 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  65.43 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  52.8 
 
 
162 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  48.34 
 
 
165 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  47.22 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  48.03 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  41.1 
 
 
180 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  41.61 
 
 
196 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  43.54 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  42.86 
 
 
178 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  38.71 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  38.71 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  40 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  43.08 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  37.89 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  43.65 
 
 
181 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  38.26 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  35.58 
 
 
193 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  38.16 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  37.5 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  38 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  38 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  37.4 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  38.46 
 
 
176 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  38.46 
 
 
176 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  38.46 
 
 
176 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  32.52 
 
 
179 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.9 
 
 
179 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  32.48 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  34.19 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  31.37 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  32.52 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  38.2 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  33.33 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  34.88 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  38.4 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  32.34 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  33.05 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.03 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  28.87 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  26.57 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  24.68 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  23.4 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  28.19 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  29.8 
 
 
181 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  30.69 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  27.91 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  25.61 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  21.01 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  25.83 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  25.83 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.7 
 
 
364 aa  48.5  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  25.32 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  25.83 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  26 
 
 
167 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.46 
 
 
162 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  26.11 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  25.33 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  23.18 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  36.36 
 
 
232 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  24.81 
 
 
364 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  24.67 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  26 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  26 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  26 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  24.67 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  26.96 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.06 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  26.5 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  42.22 
 
 
211 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  25.49 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  26.32 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  28.12 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  24.14 
 
 
210 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  27.05 
 
 
205 aa  40.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>