93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2568 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  100 
 
 
171 aa  350  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  43.35 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  41.57 
 
 
181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  40.24 
 
 
196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  40.82 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  40.71 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  35.03 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  36.36 
 
 
162 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  42.98 
 
 
163 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  41.91 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  35.58 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  42.31 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  42.15 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  42.15 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  41.32 
 
 
163 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  36.08 
 
 
162 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  41.09 
 
 
178 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  40.94 
 
 
166 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  35.67 
 
 
162 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  37.11 
 
 
162 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  37.59 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  42.15 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  41.32 
 
 
163 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  34 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  32.7 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  31.65 
 
 
176 aa  87.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  32.5 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  31.87 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  34.88 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  34.88 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  34.88 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  34.88 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  31.98 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  36.3 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  32.72 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  31.33 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  31.33 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  35 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  31.54 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  32.47 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  31.54 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  32.19 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  31.01 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  35.42 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  38.84 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  35.61 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  36.13 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  31.54 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  35.29 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  23.7 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  29.1 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  36.03 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  29.84 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  27.97 
 
 
131 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  29.35 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  32.77 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  29.03 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  33.71 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.03 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  31.76 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  27.78 
 
 
364 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.03 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  26.56 
 
 
378 aa  53.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.44 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  26.32 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  29.77 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  27.06 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  24.82 
 
 
350 aa  48.1  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  20.25 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  29.01 
 
 
210 aa  47.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  25.58 
 
 
205 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  32.61 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  27.69 
 
 
228 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  25.53 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  26.5 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  20.37 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  29.32 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  18.99 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  21.53 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  20.83 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  26.72 
 
 
232 aa  44.3  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  23.04 
 
 
672 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  18.75 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  32.61 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  28.91 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  18.35 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  24.56 
 
 
119 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  21.74 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  34.29 
 
 
651 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  38.46 
 
 
711 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  26.72 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>