75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3636 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  95.68 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  50.62 
 
 
156 aa  167  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  55.73 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  51.97 
 
 
131 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  51.94 
 
 
163 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  51.16 
 
 
165 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  49.61 
 
 
170 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  46.97 
 
 
160 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  45.07 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  43.51 
 
 
364 aa  123  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  45.31 
 
 
378 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  41.67 
 
 
364 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  41.84 
 
 
350 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  43.12 
 
 
200 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  43.12 
 
 
200 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  40.83 
 
 
152 aa  87.8  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  40.16 
 
 
181 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  36.92 
 
 
222 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  36.5 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  28.75 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  32.31 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  32.06 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  33.33 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  29.84 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  30.94 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  26.79 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  28.57 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  29.41 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  27.08 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  29.2 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  28.89 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  29.22 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  27.41 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  27.41 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  25.81 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  26.67 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  31.65 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  27.03 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  27.03 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  27.03 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  26.13 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  26.13 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  30.83 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  30.83 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  27.88 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  27.88 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  30.83 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  30.83 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  25.19 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  28.67 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  25 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  28.67 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  33.64 
 
 
228 aa  47.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  25.23 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  25.89 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  25.89 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  28.32 
 
 
173 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  24.64 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  25.23 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  26.03 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  30.3 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  31.58 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  27.41 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  29.46 
 
 
197 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  24.22 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  25.35 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  26.88 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  29.92 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  25.13 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  25.69 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  26.19 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  29.9 
 
 
181 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>