57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0212 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  31.47 
 
 
172 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  27.27 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  27.27 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  27.27 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  31.08 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  31.08 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  28.77 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  28.08 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  28.08 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  28.08 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  27.59 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  29.08 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  33.83 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  31.94 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2398  hypothetical protein  34.34 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0988059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  34.55 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  38.89 
 
 
222 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1465  hypothetical protein  36.94 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1560  hypothetical protein  36.94 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0206822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1313  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0248  hypothetical protein  34.33 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76557  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  37.21 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  27.78 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  33.91 
 
 
210 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1306  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0193608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  31.62 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  28.26 
 
 
152 aa  52  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  25.83 
 
 
199 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  29.38 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  27.45 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  24.82 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  28.31 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  31.53 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2170  hypothetical protein  28.71 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.122889  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  27.15 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  30.28 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1939  hypothetical protein  32.26 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  31.53 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  28.46 
 
 
350 aa  45.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  30.63 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0579  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.461957  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  26.9 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  27.35 
 
 
155 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  30.63 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  28.57 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1563  hypothetical protein  25.22 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0151315  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  27.83 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  29.91 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  29.91 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  29.91 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  29.91 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>