129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0502 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  40.88 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  40.98 
 
 		 277 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  30.69 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  43.48 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  28.1 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  37.74 
 
 		 261 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 260 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 254 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  46.94 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  41.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  48.98 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  28.09 
 
 		 918 aa  45.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  44.9 
 
 		 261 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 261 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 261 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 266 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  25.93 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.82 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.21 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2517  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0400027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51900  transcriptional regualtory protein, GlmR, DeoR family  46.94 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5410  DeoR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378654  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3677  DeoR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.488324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73190  GlmR transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5292  DeoR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6351  GlmR transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  43.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  25.74 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  46 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  43.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1287  transcriptional regulator, DeoR family  42.31 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  25.93 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5727  DeoR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2008  putative glycerol-3-phosphate regulon repressor  43.1 
 
 		 271 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  normal  0.0287026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  34.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  46.94 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5596  transcriptional regulator, DeoR family  44.9 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5118  regulatory protein, DeoR  44.9 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  26.92 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  46 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  42.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  48.98 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5428  DeoR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  40.82 
 
 		 256 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  42.86 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  38.03 
 
 		 250 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2776  transcriptional regulator, DeoR family  46 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 259 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 		 262 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>