More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0545 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0545  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.27 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  34.92 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  33.75 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2674  DeoR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.71 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.93 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.93 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.93 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.93 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0119  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  31.43 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.2 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.71 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1159  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.56 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.19 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  31.4 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  36.41 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  36.56 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.4 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.78 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.19 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.78 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.78 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.71 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.19 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.67 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.17 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.17 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.78 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.78 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  31.98 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.81 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.87 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06394  hypothetical protein  36.72 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>