More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2923 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 362 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  47.95 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3563  regulatory protein DeoR  45.43 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21330  transcriptional regulator  48.51 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149427  normal  0.181929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29000  transcriptional regulator  40.92 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2682  regulatory protein DeoR  39.89 
 
 		 378 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191466  normal  0.937043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03440  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  40.11 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4061  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  38.25 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  39.02 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.76 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.01 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.63 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.22 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.94 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.11 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.05 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.65 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  27.74 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  24.28 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.78 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  34.86 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  29.93 
 
 		 352 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  23.55 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.68 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  23.67 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.94 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  27.62 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  27.99 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.61 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.32 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  25.88 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  32.67 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  30.94 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  30.94 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.14 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  28.92 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  30.94 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  30.94 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  22.92 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.09 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  30.23 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.4 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.35 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 326 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.35 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  27.92 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  32.6 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.79 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.79 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  25.09 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 338 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  22.7 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  25.45 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  23.46 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  27.56 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  28.25 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 335 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>