More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1206 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1206  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
516 aa  1056    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.628402  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0020  sigma-54 dependent transcriptional regulator  51.33 
 
 
530 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2519  putative sigma54 specific transcriptional regulator  44.4 
 
 
517 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431147  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.78 
 
 
521 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  40.96 
 
 
512 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  40.56 
 
 
512 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.23 
 
 
512 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.04 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 
533 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  41.1 
 
 
532 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2692  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40.79 
 
 
532 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.35 
 
 
684 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000451  transcriptional regulator  43.16 
 
 
543 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.219758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0538  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.46 
 
 
473 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102949  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05873  nitric oxide reductase regulator  33.89 
 
 
542 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5424  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.08 
 
 
505 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5583  Fis family transcriptional regulator  42.72 
 
 
508 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468143  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4418  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.73 
 
 
466 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3263  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.96 
 
 
464 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000257125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03806  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.21 
 
 
440 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.03 
 
 
467 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.73 
 
 
467 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2812  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.77 
 
 
466 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0098  Fis family transcriptional regulator  42.2 
 
 
510 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42970  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 
503 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.076623  normal  0.105875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.22 
 
 
469 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1788  sigma-54 factor, interaction region  37.85 
 
 
542 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.337598  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.22 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  37.63 
 
 
668 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2534  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  35.55 
 
 
517 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.72 
 
 
468 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  37.37 
 
 
668 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  41.98 
 
 
466 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03881  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ZraS: response regulator/sigma54 interaction protein  40.89 
 
 
441 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4021  transcriptional regulatory protein ZraR  40.89 
 
 
441 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0128092  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4497  transcriptional regulatory protein ZraR  40.89 
 
 
441 aa  243  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000279415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03834  hypothetical protein  40.89 
 
 
441 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4454  transcriptional regulatory protein ZraR  41.21 
 
 
441 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209341  hitchhiker  0.000519331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3609  putative transcriptional regulator  37.12 
 
 
503 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1208  two component signal transduction response regulator  42.9 
 
 
470 aa  243  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0354694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3424  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.17 
 
 
466 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.89 
 
 
441 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.96 
 
 
458 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0839917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2116  Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 
579 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.93 
 
 
461 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3111  NifA subfamily transcriptional regulator  35.45 
 
 
547 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4549  transcriptional regulatory protein ZraR  40.89 
 
 
441 aa  242  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000369022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2062  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.26 
 
 
449 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000496565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.06 
 
 
591 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1698  helix-turn-helix, Fis-type  36.72 
 
 
540 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 
473 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0067  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  36.13 
 
 
550 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0861439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29620  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  34.75 
 
 
517 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2330  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.87 
 
 
466 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.87 
 
 
690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5338  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.62 
 
 
462 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1095  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  38.97 
 
 
530 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.736443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5475  transcriptional regulatory protein ZraR  40.58 
 
 
441 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.05 
 
 
690 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4238  transcriptional regulatory protein ZraR  40.58 
 
 
441 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.020936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.28 
 
 
688 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0823  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.5 
 
 
592 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0851  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  37.22 
 
 
527 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.641231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.24 
 
 
597 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1713  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  49.12 
 
 
460 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0839  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.5 
 
 
592 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.5 
 
 
592 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3625  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.46 
 
 
449 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  38.96 
 
 
471 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3194  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.5 
 
 
592 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.75 
 
 
480 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4159  sigma-54 dependent transcriptional regulator, Fis family  42.5 
 
 
592 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.778459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  42.24 
 
 
471 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.4 
 
 
463 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5051  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 
460 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610108  normal  0.479337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.64 
 
 
690 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  42.95 
 
 
448 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02702  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.5 
 
 
592 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.51 
 
 
452 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  40.57 
 
 
441 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3002  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.68 
 
 
592 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02664  hypothetical protein  42.5 
 
 
592 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.94 
 
 
690 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  40.57 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.82 
 
 
473 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.06 
 
 
592 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1260  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.5 
 
 
452 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000141339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  39.69 
 
 
455 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.78 
 
 
687 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.82 
 
 
473 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4272  sigma-54 dependent response regulator  47.84 
 
 
457 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1259  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.6 
 
 
445 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1152  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  47.6 
 
 
445 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.23 
 
 
748 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3629  two-component system response regulator  47.6 
 
 
445 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4385  transcriptional regulatory protein ZraR  40.57 
 
 
441 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4581  transcriptional regulatory protein ZraR  40.25 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0110  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.200769  normal  0.23433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1061  transcriptional regulator NifA  40.36 
 
 
582 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.798583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>