33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02450 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0851  beta-lactamase domain protein  77.19 
 
 
255 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  50.29 
 
 
283 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0708  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  25.71 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  25.14 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  25.14 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  26.9 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 
707 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  22.63 
 
 
309 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
256 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  23.91 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  38.75 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  28.09 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.51 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.03 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  25.9 
 
 
285 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  25.9 
 
 
285 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  25.9 
 
 
285 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>