221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0844 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  48.05 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  48.09 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  45.7 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  47.18 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.14 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.4 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  43.44 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.25 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  43.72 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.42 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  38.13 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  38.13 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 796 aa  125  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  28.98 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  28.16 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.55 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.55 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.55 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.56 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.24 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  31.53 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  30.15 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  31.79 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  23.23 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.79 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.54 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.27 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.34 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  42.37 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.91 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.63 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 593 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.81 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  25.47 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.35 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  23.58 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.56 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  21.7 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.81 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  26.26 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 		 515 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.74 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.4 
 
 		 644 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  27.85 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  23.22 
 
 		 327 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 314 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  20.98 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  22.55 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.12 
 
 		 602 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.98 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.98 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26.55 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 635 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  22.84 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  25.89 
 
 		 813 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  21.34 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  22.4 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.09 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>