38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4352 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 316 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  51.6 
 
 		 319 aa  338  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.6 
 
 		 329 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  41.01 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  39.3 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.42 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  38.36 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.41 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.34 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.34 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.01 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.88 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  22.99 
 
 		 384 aa  85.9  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  27.16 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  26.52 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.7 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 796 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.38 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.97 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  25.29 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  24 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  25 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  25.6 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  23.67 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  24.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  22.34 
 
 		 557 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.54 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>