29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1625 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  100 
 
 
331 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  51.21 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  49.39 
 
 
327 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.53 
 
 
329 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.08 
 
 
319 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  39.1 
 
 
345 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.1 
 
 
345 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.78 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.59 
 
 
316 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.07 
 
 
339 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  35.54 
 
 
330 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.7 
 
 
326 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  28.79 
 
 
384 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  38.26 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  25.25 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 
252 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.58 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  22.31 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  21.67 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  24.39 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.28 
 
 
254 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  21.29 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  22.22 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
259 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>