178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1579 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  92.46 
 
 		 252 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  61.51 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  56.87 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  40.62 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  42.97 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  40.83 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.35 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  40.25 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.52 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.4 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  32.82 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.13 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  37.34 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.71 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 		 796 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  31.82 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  31.4 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  32.58 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.6 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.24 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.21 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.21 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.21 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.22 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  29.15 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.61 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  28.22 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.89 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.27 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.59 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  26.88 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.02 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  28.28 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.98 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.9 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.53 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.34 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  26.12 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.51 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  24.07 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.26 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  23.96 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.42 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  28.46 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.29 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  25.52 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.18 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.26 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  26.87 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.69 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>